西元2029年，在情报化的网路覆盖整个地球的同时，电脑犯罪也成了习以为常的现象。草薙素子少校隶属于人称“攻壳机动队”的公安九课，是一个除了大脑以外全身都经过特殊改造的改造人，她为了一名身份不详的骇客“傀儡师”而展开调查然而这却是另一项重大阴谋的开端……
