《缘之空无修版》主人公春日野悠和他的双胞胎妹妹穹在父母事故身亡后，来到了位于奥木染镇的祖父家中，在那里开始新的生活。与昔日到访奥木染镇时认识的天女目瑛和依媛奈绪重逢，认识了新的朋友，以及被妹妹所依赖，就这样悠的新生活展开了。在安稳的日子里，悠渐渐地注意到了对自己来说谁是最重要的存在……
